ImageJ

科学的画像処理のためのスクリプタブルJavaアプリ

ImageJ は、画像を分析することに特化したJavaベースのグラフィックデザインプログラムで、互換性のあるWindowsデスクトップに無料でインストールできます。これは、オンラインアプレットとしても、ダウンロード可能なアプリケーションとしても実行できます。さらに重要なのは、この写真ツールが8ビット、16ビット、32ビットの画像を表示、編集、分析、処理、保存、印刷できることです。

言うまでもなく、TIFF、 GIF、 JPEG、 BMP、PGM、DICOM、ASCII、FITS、スプレッドシートのようなテキスト形式の生データファイルなど、最も一般的な画像ファイルタイプもサポートしています。ImageJは、Meesoftの Image Analyzer やCalvin Hassの JPEGsnoopに対する注目すべき代替手段となる可能性があります。

ImageJは何に使われますか？

ImageJの主な目的は、 面積とピクセル値を計算すること であり、これはグラフィックデザイナーにとって非常に役立ちます。しかし、それだけではなく、距離や角度を測定し、密度ヒストグラムを作成し、ラインプロファイルプロットも作成できます。さらに、コントラスト操作、シャープニング、スムージング、エッジ検出、メディアンフィルタリングなどの他の標準画像処理機能も提供しています。 幾何学的変換 として、スケーリング、回転、反転もこのデジタル写真ユーティリティを使用して行うことができます。

ImageJのカラー処理機能は強力で多用途であり、画像に対してさまざまな色に基づく分析や修正を行うことができます。特に、RGB、HSB、CIE Labなど、いくつかのカラースペースをサポートしており、分析ニーズに応じて画像を正確に処理できます。このソフトウェアは色分離を可能にし、画像を個々の色チャネルに分割することができ、それぞれを別々に修正できます。

Javaベースの画像処理ソフトウェアは、画像スタックを扱うことができます。これは、単一のウィンドウを共有するマルチスレッドの画像シリーズです。これにより、マルチCPUハードウェア上で時間のかかる操作を並行して実行できます。タスクを自動化し、プレインストールされた マクロを通じてカスタムツールを作成できます。コマンドレコーダーを使用してマクロコードを生成し、マクロデバッガーを使用するとデバッグが可能になります。アプリ内で楽しめるマクロは 300以上 あり、 500以上 のプラグインが利用可能です。

ImageJとFiji

記録のために、 FijiはImageJと似ていますが 、ImageJ2に基づいています。これは、多次元画像データのための最初のインストールの完全な書き直しです。Fijiの開発は、多くのバンドルされたプラグインを持つ ImageJ2の配布を提供すること を目的としています。詳細なアルゴリズムの説明とチュートリアルを提供することで、秩序あるメニュー構造と広範な文書を生成する更新システムを統合しています。特にライフサイエンスに関わるユーザーには、FijiがImageJよりも推奨されます。なぜなら、 Bio-Formatsプラグイン が装備されているからです。

Bio-Formatsは、顕微鏡ベンダーが画像を保存するために使用するほとんどの独自ファイル形式を開くのに大いに役立ちます。たとえば、光学顕微鏡を通じて登録、セグメンテーション、その他の高度な画像処理アルゴリズムを実装する 3Dビューワー は、データをより良く視覚化できます。含まれているTrakEM2コンポーネントは、幼虫のショウジョウバエの脳における神経系の系譜を分析するために成功裏に使用され、強化されました。 Fijiは、異なるソースから複数のコンポーネントをインストールする必要を回避することを可能にします 。

良い画像解析ツール

ImageJは、優れたスリムな画像解析ソリューションです。それは読み込みと はるかに速く実行される だけでなく、 プログラマーでない ユーザーが操作するのも 簡単です 。プラグインのための「コンパイルと実行」機能を含んでいるので、コード管理システムを学ぶ必要はありません。しかし、より多くの組み込みマクロやプラグインを提供するより良い処理が必要な場合、Fijiは特にライフサイエンスの分野にいる場合はより良い選択肢となるでしょう。